Die System-Dateien von eva/3 Application Builder ermöglichen es zentrale Einstellungen für ein eva/3 Projekt vorzunehmen. Die wichtigsten eva/3 spezifischen Eigenschaften eines Projektes befinden sich in der Datei System.eva3. Neben einfachen Eigenschaften lassen sich in dieser Datei auch Verweise auf weitere (eventl. notwendige) Dateien einstellen.
Beispielweise kann ohne die Datei System.forms kein Formular bearbeitet werden. Dagegen könnte man in einfachen Projekten auf die Benutzerverwaltung (System.user) verzichten.